Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms