Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Clec18aQ7TSQ1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec18aQ7TSQ1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms