Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dsg1bQ7TSF1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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