Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek5Q7TSC3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms