Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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Shq1Q7TMX5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Shq1Q7TMX5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Shq1Q7TMX5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Shq1Q7TMX5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Shq1Q7TMX5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Shq1Q7TMX5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Shq1Q7TMX5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms