Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ScocQ78YZ6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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ScocQ78YZ6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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ScocQ78YZ6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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ScocQ78YZ6 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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ScocQ78YZ6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ScocQ78YZ6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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