Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mindy1Q76LS9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mindy1Q76LS9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms