Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc88cQ6VGS5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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