Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms