Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim37Q6PCX9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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