Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Mvb12bQ6KAU4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Mvb12bQ6KAU4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mvb12bQ6KAU4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms