Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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