Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scaf8Q6DID3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms