Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smarca2Q6DIC0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms