Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Pdzrn3Q69ZS0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Pdzrn3Q69ZS0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Pdzrn3Q69ZS0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Pdzrn3Q69ZS0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Pdzrn3Q69ZS0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Pdzrn3Q69ZS0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzrn3Q69ZS0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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