Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ric1Q69ZJ7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ric1Q69ZJ7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms