Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit1Q64282 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms