Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim24Q64127 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim24Q64127 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1534.5 ms