Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrn1Q61809 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lrrn1Q61809 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms