Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ifi47Q61635 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms