Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ecm1Q61508 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ecm1Q61508 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ecm1Q61508 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ecm1Q61508 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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