Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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PcolceQ61398 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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PcolceQ61398 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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PcolceQ61398 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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