Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms