Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms