Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Slc6a4Q60857 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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