Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cnot7Q60809 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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