Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trim38Q5SZ99 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trim38Q5SZ99 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trim38Q5SZ99 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trim38Q5SZ99 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Trim38Q5SZ99 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trim38Q5SZ99 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trim38Q5SZ99 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trim38Q5SZ99 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trim38Q5SZ99 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trim38Q5SZ99 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim38Q5SZ99 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trim38Q5SZ99 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trim38Q5SZ99 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trim38Q5SZ99 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trim38Q5SZ99 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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