Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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