Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf12Q5SPL2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms