Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Trappc1Q5NCF2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Trappc1Q5NCF2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Trappc1Q5NCF2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Trappc1Q5NCF2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Trappc1Q5NCF2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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