Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms