Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
H2al1nQ497L1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
H2al1nQ497L1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms