Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap2Q3V1H1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ckap2Q3V1H1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms