Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc27Q3V036 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms