Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
BB287469Q3UT53 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BB287469Q3UT53 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms