Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fchsd2Q3USJ8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fchsd2Q3USJ8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms