Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Acsf3Q3URE1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Acsf3Q3URE1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Acsf3Q3URE1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms