Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccdc33Q3ULW6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccdc33Q3ULW6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ccdc33Q3ULW6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ccdc33Q3ULW6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc33Q3ULW6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc33Q3ULW6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc33Q3ULW6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc33Q3ULW6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc33Q3ULW6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc33Q3ULW6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc33Q3ULW6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc33Q3ULW6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc33Q3ULW6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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