Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
E330014E10RikQ3UL33 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms