Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp19Q3UJD6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms