Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Nkx6-3Q3UHX8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Nkx6-3Q3UHX8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Nkx6-3Q3UHX8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Nkx6-3Q3UHX8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms