Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U595 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U595 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U595 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U595 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U595 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U595 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U595 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U595 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U595 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U595 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U595 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U595 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U595 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U595 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U595 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U595 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms