Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rnf40Q3U319 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rnf40Q3U319 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rnf40Q3U319 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms