Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XylbQ3TNA1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms