Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pde12Q3TIU4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pde12Q3TIU4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms