Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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