Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpusd3Q14AI6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms