Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms