Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms