Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
1700061G19RikQ08EE8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms